W 2011 r. Agencja wpłaciła do Funduszu Rekompensacyjnego już 240 mln zł i pozostaje jej do wpłaty do końca roku jedynie 25 mln zł w postaci dwóch zaliczek, odpowiednio 5 mln zł i 20 mln zł. Łączna kwota przekazana przez ANR na rzecz Funduszu w okresie 2006-2011 wynosi 2,7 mld zł.

Fundusz Rekompensacyjny powstał na mocy ustawy z 8 lipca 2005 r. o realizacji prawa do rekompensaty z tytułu pozostawienia nieruchomości poza obecnymi granicami Rzeczypospolitej Polskiej. Z Funduszu wypłacane są odszkodowania dla Zabużan, czyli Polaków repatriowanych do Polski w latach 1944-1952 z terenów należących przed II wojną światową do Polski, tzw. Kresów wschodnich.