Ponadto, posiadacz zwierzęcia ma obowiązek złożenia w biurze powiatowym ARiMR zgłoszenia uboju zwierzęcia w gospodarstwie. Zgłoszenia należy dokonać w terminie 30 dni w przypadku świń oraz w terminie 7 dni w przypadku bydła, owiec i kóz, od dnia w którym ubój miał miejsce. W przypadku zgłoszeń ubojów dotyczących bydła do zgłoszenia należy dołączyć paszporty zwierząt. Posiadacz dokonuje zgłoszenia na właściwym formularzu udostępnionym przez Agencję. Zgłoszenia można również dokonać za pośrednictwem sieci internetowej. Dokonując zgłoszenia trzeba potwierdzić zgodność danych w nim zamieszczonych ze stanem faktycznym. W przypadku, gdy ubój na użytek własny ma miejsce w innym gospodarstwie niż gospodarstwo, w którym zwierzę jest utrzymywane, przemieszczenie zwierzęcia do miejsca uboju powinno być odnotowane w CBD i w paszporcie zwierzęcia.

ARiMR przypomina też, że na wszystkich posiadaczach: bydła, owiec, kóz i świń - ciąży obowiązek terminowego dokonywania w "swoich" biurach powiatowych Agencji zgłaszania innych zdarzeń dotyczących ich stad, czyli muszą powiadamiać: o urodzeniach, przemieszczaniu zwierząt do i z gospodarstwa, ich padnięciu czy zabiciu. Do zgłoszenia padnięcia i zabicia bydła należy dołączyć paszport bydła. O każdym przypadku padnięcia bydła, owiec lub kóz posiadacz zwierząt gospodarskich ma też obowiązek natychmiastowego informowania powiatowego lekarza weterynarii.

Przestrzeganie terminowego zgłaszania zdarzeń  dotyczących bydła podlega kontroli w ramach "Systemu wzajemnej zgodności w obszarze identyfikacji i rejestracji zwierząt"  i w przypadku stwierdzenia nieprawidłowości w wypełnianiu obowiązków związanych z ubojem czy innymi zdarzeniami w stadzie może skutkować nałożeniem sankcji finansowych na rolnika, który z nich się nie wywiązał.